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科学普及工作是国家重点实验室肩负的社会责任，对外开放也是国家重点实验室的重要特征。根据科技部统一部署，实验室每年5月面向社会举办“公众开放日”活动。

开放日活动通过科学主题演讲、科学实验展示以及现场参观等形式，向观众全面介绍微生物代谢国家重点实验室整体情况，同时这种融入科技元素的活动，在互动中为公众提供体验科学与创新的机会，促进微生物科学技术与生活和工业经济相关性的普及，激发社会对生命科学的兴趣和认同。
开放日活动按照社会需求，不定期的面向特定机构、学校组织有针对性的活动，以中小学生为重点服务对象，致力于培养青少年的创新意识和创新能力。

对国家重点实验室来说，开放交流既是义务，也是机会。促进交流与合作，有利于实验室瞄准学科前沿，保持高水平的学术地位和影响力，同时有利于推动科研创新，增强对社会承担的责任。